立法院司法及法制委員會昨日召開「憲政、獨立機關首長代理制度之現況」專題報告。藍白立委質疑，多項人事同意案遭國會否決後，政府改以指派代理形式視事，實質架空立法院監督權，呼籲修法將代理制度提升至法律位階並明訂期限。法務部則回應，代理合乎規範且並未架空職權，若代理期限過短恐不利檢察體系穩定。
近期多項憲政與獨立機關人事案在立法院觸礁，導致多個首長職位由副首長或指派人員代理。立法院日前二度否決司法院正副院長及大法官人事案，總統府隨即指派大法官謝銘洋代理司法院長；最高檢察署檢察總長提名人徐錫祥人事案遭否決後，亦獲指派代理檢察總長。
在三大獨立機關部分，公平會去年1月主委及委員任命案遭否決，目前由副主委陳志民代理主委；中選會今年3月否決3名委員提名，行政院已重新提出沈淑妃、蔡維哲、黃謀信等人事案送審；國家通訊傳播委員會（NCC）則因去年11月4名委員提名遭否決，現僅剩3名委員且任期將於7月31日屆滿。在此僵局下，總統府日前也已提名下屆監察委員共29人咨請立法院審議。
國民黨立委林沛祥對此表示，當代理無期限延長、進而取代正式任命時，立法院的人事同意權將被實質架空。他主張應聚焦三大改革：建立合理提名期限、設立代理制度明確上限，以及要求政府定期向國會報告補提名進度，避免形成「國會不同意則長期代理」的慣例，損及憲政根基。
國民黨立委翁曉玲指出，現行「各機關職務代理應行注意事項」僅針對常任文官，並未涵蓋政務首長。她認為應檢討相關行政命令，將代理制度提升到法律位階，明文規定於法律組織法中。針對獨立機關，翁曉玲特別示警，若NCC委員任期屆滿後，行政院執意指派主任秘書等事務官代理，將是完全違法亂政的行為，強調寧可讓機關運作暫時停擺，也絕不能違反法定組織程序。
民眾黨立委陳昭姿則批評，現行檢察總長出缺僅依慣例指定代理，缺乏法律層級規範。當徐錫祥人事案遭立法院否決後，隨即又獲指派代理檢察總長，等同變相架空國會。對此，民眾黨團已提案修法，明訂代理檢察總長不得超過3個月，且遭國會否決者不得擔任代理人。
面對朝野立委質疑，司法院祕書長高金枝坦言，賴清德總統與立法院在人事案上必須折衝協力，目前機關單位只能繼續等待。法務部長鄭銘謙則強調，徐錫祥是非常適合的人選，由其代理檢察總長完全合乎規範，絕對沒有架空立法院職權；他同時示警，若立法院修法將代理期限縮得過短，恐因頻繁更換首長而對檢察體系的穩定運作造成不利影響。
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